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description générale: des jeux de données concernant la qualité microbiologique des eaux de surface (via l'ADN) du bassin-versant de l'Yzeron en période de temps sec ont été produits par qPCR via la trousse qPCR OTHU. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (ADN, résultats qPCR des eaux de surface) - Contexte Ces travaux permettent d’étudier les mélanges de bactéries exogènes (incluant des agents pathogènes) et endogènes du cours d’eau en période de temps sec. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars 2023
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Campagne de collectes de sédiments sur plusieurs bassins d'infiltration de la métropole Mesures des quantité de raticides dans les matrices sédimentaires Evaluation en laboratoire de l'impact des raticides sur un organisme sentinelle aquatique vivant dans ces sédiments (le vers tubificidé Tubifex tubifex) Mesures écophysiologiques réalisées : réserves énergétiques chez les organismes + à compléter
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Photographie une fois par jour du bassin d'infiltration depuis le bungalow OTHU.
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Données météorologiques issues du suivi en continu de plusieurs stations (pluie, température, autres variables) sur le bassin versant de l'Yzeron depuis 1997, dans le cadre de l'Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine (OTHU)
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Photographie une fois par jour du bassin de rétention depuis le bungalow OTHU.
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Relevé topographique du réseau d'amené des eaux au bassin de rétention et de la conduite de transfert entre bassin de rétention et bassin d'infiltration sur le site de Chassieu. Le 04/06/2013
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- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés bactériennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron et Django-R et de sédiments urbains issus de la métropole de Lyon sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivie du cell index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface et les sédiments ont été analysés en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et courbe de croissance/d'amplification des communautés bactériennes. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, physico-chimie, suivie du Cell index/,intégrité cellulaire, données de cytométrie, imagerie) - CONTEXTE : Continuation du développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires développés en 2022, 2023 afin de caractériser le degré d'infectiosité des bactéries d'eaux de surfaces et maintenant de sédiments. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron, de Django R et aux sédiments urbains issus de la métropole de Lyon et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés des milieux. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEUX : bassin-versant de l'Yzeron, Django-R, Métropole de Lyon (69, France) - PÉRIODE : Juin et Novembre 2024
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Mise à jour et interprétation des banques de données métagénomiques issues de séquençage massif afin d'obtenir une image de la communauté microbienne des eaux de ruissellement, de la nappe et/ou des sédiments Analyse qualitative des communautés bactériennes présentes dans le milieu (métataxogénomique) Sites OTHU: Django-Reinhart (Chassieu), sites satellites (Feyzin, Minerve, Raquin) Autre(s): Garibaldi (Lyon)
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Suivi de l'impact de l'infiltration sur la qualité des eaux souterraines sous le bassin d'infiltration de Django Reinhart Le dispositif expérimental est basé sur un ensemble de piézomètres situés à l'amont hydraulique du bassin d'infiltration (piézomètres SC1 à SC6), à l'aplomb du bassin d'infiltration (piézomètres SC7 à SC11), en position latérale gauche (piézomètres SC12, SC26 et SC27) et droite (piézomètre SC13) du bassin d'infiltration et disposés à l’aval du bassin (piézomètres SC28, SC29 et SC14). Enregistrements continus sur plusieurs piézomètres depuis 2003 (palier horaire): - hauteur d'eau - température - conductivité électrique - oxygène dissous
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données issues de travaux spécifiques réalisés sur le sous-bassin rural du Mercier, dans le cadre de la thèse de B. Sarrazin (2012)