- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : (données ponctuelles par sites) données : infiltration, couverture végétale, plants species, soil microbiology (taxa abundance, diversity), soil texture, soil structure, porosity, site geometry, occupation des sols - FORMAT : tableau de données - CONTEXTE : Projet europpéen BIORESTORM & thèse de doctorat - BUT : Amelioration de la compréhension des mecanismes biologiques qui influencent la fonction infiltration des solution fondées sur la nature pour la gestion de l'eau pluviale en ville - LIEU : DJANGO et autres noues non suivies par l'OTHU (LYON) - PÉRIODE : été 2025 et 2026

Vidéos enregistrées en continu et déchargées aux cours de campagnes: - observation des phénomènes au cours des remplissages et vidanges du bassin - estimation de la hauteur d'eau et des vitesses de surface

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés bactériennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron et Django-R et de sédiments urbains issus de la métropole de Lyon sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivie du cell index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface et les sédiments ont été analysés en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et courbe de croissance/d'amplification des communautés bactériennes. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, physico-chimie, suivie du Cell index/,intégrité cellulaire, données de cytométrie, imagerie) - CONTEXTE : Continuation du développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires développés en 2022, 2023 afin de caractériser le degré d'infectiosité des bactéries d'eaux de surfaces et maintenant de sédiments. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron, de Django R et aux sédiments urbains issus de la métropole de Lyon et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés des milieux. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEUX : bassin-versant de l'Yzeron, Django-R, Métropole de Lyon (69, France) - PÉRIODE : Juin et Novembre 2024

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données de séquençage du segment V4 de du gène de l’ARNr 16S pour les pelotes fécales de 5 mammifères (homme, chat, chien, mouton, campagnol) - FORMAT : Tableau Excel contenant le descriptif des échantillons, et les tables de contingence. - CONTEXTE : Ces données ont été produites dans le cadre des activités de l'OTHU et s'inscrivent dans les travaux multidisciplinaires de BPOE-LEM. Le but est la création d'une base de données de référence du gène 16S rRNA pour pouvoir par la suite identifier les sources de contamination fécale dans la métropole de Lyon. Cette base de données sera enrichie au fil du temps dès de nouveaux échantillons seront obtenus. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - LIEU : Métropole de Lyon, Auvergne - PÉRIODE : 2025-maintenant

Mise à jour et interprétation des banques de données métagénomiques issues de séquençage massif afin d'obtenir une image de la communauté microbienne des eaux de ruissellement, de la nappe et/ou des sédiments Analyse qualitative des communautés bactériennes présentes dans le milieu (métataxogénomique) Sites OTHU: Django-Reinhart (Chassieu), sites satellites (Feyzin, Minerve, Raquin) Autre(s): Garibaldi (Lyon)

18 bassins d'infiltration sur la Métropole de Lyon Echantillonnages et analyses des sédiments accumulés à la surface des bassins - paramètres pédologiques - éléments majeurs - métaux traces - micropolluants organiques : * HAP * PCB et PCB de type dioxine * dioxines et furanes * alkylphénols * pesticides

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants au sein d'un déversoir d'orage d'un bassin versant résidentiel. Autosurveillance pour la Métropole de Lyon. Paramètres hydrauliques: débits (Hauteurs/vitesses), pluviométrie (2004 à 2019) Paramètres physico-chimiques: conductivité électrique, température, pH, turbidité (2004 à 2012)

Suivi en continu du poids de six toitures végétalisées ainsi que les débits en sortie de ces toitures. Chaque toiture est indépendante, mesure 9m² (3*3) et permet d'estimer l'évolution de l'évapotranspiration. Les substrats sont modifiables en fonction des besoins.

description générale: des jeux de données concernant la qualité microbiologique des eaux de surface (via l'ADN) du bassin-versant de l'Yzeron en hiver 2024 (suite de l'étude de 2023) ont été produits par qPCR via la trousse qPCR OTHU. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (ADN, résultats qPCR des eaux de surface) - Contexte : Ces travaux permettent d’étudier les mélanges de bactéries exogènes (incluant des agents pathogènes) et endogènes du cours d’eau pour l'hiver 2024 et de comparer ces données à celles produites en 2023. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - BUT : Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: février 2024

- Description générale : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés microbiennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface ont été analysées en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et dénombrement IDEXX. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, dénombrement IDEXX, eaux de surface - physico-chimie, suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire/intégrité cellulaire, données de cytométrie) - contexte: Développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires afin de caractériser le degré d'infectiosité de microorganismes d'eaux de surfaces. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés du milieu. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: novembre 2023