Mise à jour et interprétation des banques de données métagénomiques issues de séquençage massif afin d'obtenir une image de la communauté microbienne des eaux de ruissellement, de la nappe et/ou des sédiments Analyse qualitative des communautés bactériennes présentes dans le milieu (métataxogénomique) Sites OTHU: Django-Reinhart (Chassieu), sites satellites (Feyzin, Minerve, Raquin) Autre(s): Garibaldi (Lyon)

Campagnes d'incubation de supports artificiels (billes d'argiles) pendant 10 jours dans la nappe de l'est lyonnais par temps humide et temps sec dans les piézomètres en amont et en aval de 6 bassins d'infiltration (Django, IUT, Minerve, Grange Blanche, Chemin de Raquin ou Pesselières et Chemin de Feyzin). Nombre de campagnes : 6 Dates : été 2015, été 2016, automne 2017, printemps 2018, automne 2018, automne 2019 Mesures réalisées : Dosage de la biomasse (protéines) et des activités (FDA et INT) des biofilms microbiens. Analyses physico-chimiques de l'eau: nutriments organiques (DOC et BDOC), nutriments inorganiques (NH4, NO2, NO3 et PO4) et Chlorures (Cl-). Extraction d'ADN et analyse de la diversité microbienne par métabarcoding 16S. Analyses fluorimètriques de la matière organique dissoute pour informations qualitatives sur une campagne.

Evaluation de l'effet d'invertébrés (vers tubificidés) sur la dynamique des nutriments dissous, des activités microbiennes et de la composition chimique des sédiments en colonnes expérimentales. Sites: IUT, Minerve, Granges Blanches, Django-Reinhardt, site témoin -Balan- Collecte de sédiments et mise en place de colonnes expérimentales (6 colonnes par sédiment - 3 avec des vers tubificidés et 3 sans vers tubificidés) Mesures réalisées : - Dynamique des nutriments (NO3, NO2, NH4, PO4) et du carbone organique dissous dans l'eau en contact avec les sédiments - Analyse de deux gaz à effet de serre (CO2 et CH4) - Analyse des teneurs en carbone organique, azote et phosphore dans les sédiments - Analyse de la réponse écophysiologique des vers aux différents sédiments (mesures des réserves énergétiques et des indicateurs de stress oxydatif) - Analyses tomographiques (scanner médical) pour évaluer la bioturbation (création de galeries) par les vers tubificidés

Campagnes de suivi de la microbiologie des sédiments et des eaux de la rivière Chaudanne sur le site de Grézieu-la-Varenne depuis 2013: - Analyses des eaux en amont, aval et au sein du DO ainsi qu'en réseau unitaire - Analyses métagénomiques au niveau des eaux de surface, des sédiments benthiques et eaux hyporhéiques - Suivi des bactéries pathogènes - Microbiologie du modèle P.aeruginosa, du modèle A.caviae, des bactéries hétérotrophes et des bio-indicateurs de contamination fécale - PCR quantitative pour évaluation de marqueurs permettant la quantification de pathogènes au cours de campagnes nycthémérales - PCR quantitative pour évaluation d'un marqueur permettant la quantification de la présence d'intégrons (classe I, II, III et classe I "clinique")

Projet CABRRES: Caractérisation chimique, microbiologique, écotoxicologique, spatio-temporelle des contaminantes des bassins de retenue des eaux pluviales urbaines (2012 à 2017); évaluation et gestion des Risques Environnementaux et Sanitaires associés: - Identification des sources des contaminants - Développement d'un modèle hydrodynamique - Caractérisation biophysico-chimique des zones de contamination - Caractérisation écotoxicologique des mêmes échantillons - Etablissement de corrélations entre tailles des particules et agents

Etude de l'évolution et de la variabilité des quantités et de la qualité des eaux urbaines en temps de pluie sur la dernière décennie – Capitalisation des chroniques de l'OTHU (projet CHRONOTHU - ZABR)- 2015 Ce projet vise à étudier la tendance d’évolution à long terme de variables caractérisant la quantité et la qualité des eaux transitant dans le milieu urbain. Il est basé presqu’exclusivement sur les données collectées et mesurées sur plus de 10 ans dans l’OTHU sur le site de Chassieu, Ecully et Yzeron (Bassin La Léchère)

Suivi de l'impact de l'infiltration sur la qualité des eaux souterraines sous le bassin d'infiltration de l'IUT sur le campus de la Doua Le site dispose de piézomètres à l'aplomb du bassin d'infiltration (piézomètres "aval") et de piézomètres en dehors de l'influence du bassin (piézomètres témoins appelés "amont"). Enregistrement continu sur les piézomètres depuis 2006 (palier horaire) : - hauteur d'eau - température - conductivité électrique - oxygène dissous

Campagnes de prélèvements d'échantillons afin d'établir une relation entre la turbidité et les valeurs de MES/DCO. Analyses par temps sec et par temps de pluie sur le site d'Ecully.

Suivi de l'impact de l'infiltration sur la qualité des eaux souterraines pour 5 bassins d'infiltration de l'est lyonnais (sur les communes de Chassieu, Corbas, Mions, St Priest) Enregistrement continu sur les piézomètres depuis 2006 (palier horaire) jusqu'en 2020 : - hauteur d'eau - température - conductivité électrique - oxygène dissous (Minerve, Granges Blanches, Chemin de Raquin, Pesselière, Chemin de Feyzin)

Campagnes d'analyses dans le cadre du projet MicroMegas afin d'évaluer les performances des techniques alternatives vis à vis des micropolluants. Concentrations moyennes évènementielles en phase dissoute et particulaires d’ETM, HAP, PBDE, Bisphénol A, pesticides, alkylphénols, en entrée et sortie du compartiment rétention du bassin Django Reinhardt et en sortie de dispositifs à la source (noue, tranchée, chaussée à structure réservoir). Analyse des efficacités des dispositifs centralisé et à la source par rapport aux dispositifs traditionnels (exutoire de réseau séparatif pluvial et parking imperméable classique. - Thèse de Robin Garnier, Thèse de Christel Sébastian - Données principalement sous fichiers Excel - Sites: Compartiment rétention du bassin Django Reinhardt (Chassieu) et Ecocampus de la Doua (noue, tranchée et parkings)