- Description générale : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés microbiennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface ont été analysées en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et dénombrement IDEXX. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, dénombrement IDEXX, eaux de surface - physico-chimie, suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire/intégrité cellulaire, données de cytométrie) - contexte: Développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires afin de caractériser le degré d'infectiosité de microorganismes d'eaux de surfaces. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés du milieu. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: novembre 2023

description générale: des jeux de données concernant la qualité microbiologique des eaux de surface (via l'ADN) du bassin-versant de l'Yzeron en période de temps sec ont été produits par qPCR via la trousse qPCR OTHU. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (ADN, résultats qPCR des eaux de surface) - Contexte Ces travaux permettent d’étudier les mélanges de bactéries exogènes (incluant des agents pathogènes) et endogènes du cours d’eau en période de temps sec. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars 2023

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants au sein d'un déversoir d'orage d'un bassin versant résidentiel. Autosurveillance pour la Métropole de Lyon. Paramètres hydrauliques: débits (Hauteurs/vitesses), pluviométrie (2004 à 2019) Paramètres physico-chimiques: conductivité électrique, température, pH, turbidité (2004 à 2012)

- DESCRIPTION Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron. Différents modes d’utilisation des terres ont été répertoriés et 10 sous-bassins homogènes en terme d’activité et d'occupation des sols ont été sélectionnés pour les analyses des sources de contamination. Plusieurs campagnes de récolte d'eaux aux différentes sources ont été réalisées (10/02/22, 15/02/22, 17/05/22, 27/06/22 et 30/06/22) - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement étudiés - CONTEXTE Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales - BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?) Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - LIEU Bassin versant emboité Mercier-Ratier. 10 sous-bassins homogènes en terme d’activité et d'occupation des sols ont été sélectionnés. - PÉRIODE Campagnes 10/02/2022 (temps sec), 15/02/2022 (temps de pluie), 17/05/2022, 27/06/2022 et 30/06/2022.

- DESCRIPTION DE LA DONNÉE: Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron via l'utilisation de pièges passifs (billes d'argile / germcatchers) favorables au développement de biofilms. Les germcatchers ont été positionnés à l'exutoire du Ratier - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement des germcatchers (billes d'argile) étudiés - CONTEXTE (DANS LE CADRE DE QUEL PROJET? QUI EST LE PROPRIÉTAIRE?...) Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales dont les ruissellements urbains - BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?) Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - LIEU exutoire du bassin-versant du Ratier - PÉRIODE positionnement en rivière de germcatchers entre Avril - juin 2022

-Caractéristiques physico-chimiques, concentrations en métaux lourds, HAP, hydrocarbures Totaux, Azote et phosphore totaux de sols de quatre bassins d’infiltration en différents points et différentes profondeurs. - Thèse de Magali Dechesne - Données principalement sous fichiers Excel (fichier joint) - Sites: Sites satellites (Boulevard des droits de l’homme, Centre routier, ZAC Pivolles, ZAC du Chêne)

Données produites depuis 2016 dans le cadre de l'OTHU pour le suivi des paramètres météorologiques. Station météo:Campbell SCI CR310. Paramètres suivis: température, humidité de l'air, ensoleillement, vitesse et orientation du vent et pluviométrie (depuis 2016)

données issues de travaux spécifiques réalisés sur le sous-bassin rural du Mercier, dans le cadre de la thèse de B. Sarrazin (2012)

Campagne de collectes de sédiments sur plusieurs bassins d'infiltration de la métropole Mesures des quantité de raticides dans les matrices sédimentaires Evaluation en laboratoire de l'impact des raticides sur un organisme sentinelle aquatique vivant dans ces sédiments (le vers tubificidé Tubifex tubifex) Mesures écophysiologiques réalisées : réserves énergétiques chez les organismes + à compléter

- description générale: données de qualité (protéines totales, INT - respiration, FDA - métabolisme générale) concernant la formation de biofilms sur germcatchers en rivière (BV Ratier/Mercier de l'Yzeron) associées à des données produites à partir d'ADN extraits de ces biofilms. Des jeux de données concernant la qualité microbiologique des biofilms (via l'ADN) ont été produits par qPCR et méta-barcoding d'amplicons du gène marqueur tpm. Des eaux de surface ont été analysées durant cette étude pour qualifier les périodes d'échantillonnage en termes de paramètres physico-chimiques et permettre des comparaisons entre microbiologie des biofilms et des eaux de surface (uniquement via qPCR et méta-barcoding d'amplicons). - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (biofilms, ADN, eaux de surface - physico-chimie) - contexte: L'étude des biofilms sur germcatchers permet de tester les aptitudes des bactéries de sources exogènes (animales, surverse de réseau unitaire) dont des formes pathogènes à coloniser les compartiments d’un cours d’eau dans un contexte (i) de compétition avec les composantes biologiques naturelles du cours d’eau mais également (ii) d’exposition à de multiples polluants chimiques dont des phytosanitaires et pharmaceutiques. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars à juin 2023