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Qualité microbiologique – analyse comparative des dangers sanitaires associés aux sédiments urbains, ruissellements et eaux de surfaces des sites Django-R et BV Yzeron: tests rapides sur épithéliums pulmonaires d’évaluation du taux d’infectiosité des 2 matrices (2024)

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés bactériennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron et Django-R et de sédiments urbains issus de la métropole de Lyon sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivie du cell index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface et les sédiments ont été analysés en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et courbe de croissance/d'amplification des communautés bactériennes.

- FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, physico-chimie, suivie du Cell index/,intégrité cellulaire, données de cytométrie, imagerie)

- CONTEXTE : Continuation du développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires développés en 2022, 2023 afin de caractériser le degré d'infectiosité des bactéries d'eaux de surfaces et maintenant de sédiments. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron, de Django R et aux sédiments urbains issus de la métropole de Lyon et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés des milieux. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans

- LIEUX : bassin-versant de l'Yzeron, Django-R, Métropole de Lyon (69, France)

- PÉRIODE : Juin et Novembre 2024

Simple

Date (Creation)
2024-01
Purpose

Etude de la qualité microbiologique des sédiments urbains, eaux de ruissellements et de eaux de surfaces des sites Django-R et BV

Yzeron

Status
Under development
Owner
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Benoit COURNOYER
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Custodian
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Baptiste Luton
Author
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Baptiste Luton
Author
  Université Lyon 1 /Inrae - LEM BPOE - Emmanuelle DANTY-BERGER
Maintenance and update frequency
As needed
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Installations de suivi environnemental
GEMET
  • physicochimie
  • micro-organisme
  • pollution
  • eau
  • ruisseau
  • gestion du risque
  • pollution de la ville
  • étude de milieu
  • milieu aquatique
  • sédiment
theme.OZCAR-Theia.rdf
  • Bacteria and virus abundance
  • Bacteria and virus diversity
Keywords
  • SNO Observil
  • ZABR
Sites OTHU
  • Chassieu Rétention (CR)
  • Bassin versant de l'Yzeron
Use limitation
Accord de réutilisation de données en accès privé et exclusif
Access constraints
Copyright
Use constraints
Other restrictions
Other constraints
Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Topic category
  • Environment
  • Inland waters
Description
Bassin versant de l'Yzeron
Begin date
2024-06-01
End date
2024-11-30
Description
Chassieu Rétention (CR)
N
S
E
W
thumbnail


Description
Bassin versant de l'Yzeron
N
S
E
W
thumbnail


Distribution format
  • txt/csv ( )

OnLine resource
Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
OnLine resource
OTHU site web ( WWW:LINK-1.0-http--related )

OTHU site web

Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date (Publication)
2010-11-23
Explanation
Non évalué
Pass
No
Statement

producteur: UMR LEM - BPOE; qPCR sur ADN de bactéries issues d'eau de surface ou de sédiments. Données de Cell index de

cellules d'épithéliums pulmonaires exposées à des communautés microbiennes issues d'eaux de surface ou de sédiments. Données

de comptage de cellules et de bactéries en cytomètrie en flux, marqués ou non.

Données brutes de quantités de copies d'un ADN cible selon unités indiquées dans le tableau xls et normalisation (ratio) sur des cibles

de référence (16S rRNA gene)

File identifier
9b225934-fe10-4b9f-8e76-33e9d817c957 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2025-02-20T14:16:41
Metadata standard name
ISO 19115:2003/19139
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  OTHU - Nicolas WALCKER
Villeurbanne , 69100 , France
http://graie.org/othu/index.htm
 
 

Overviews

overview overview

Spatial extent

N
S
E
W
thumbnail


N
S
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thumbnail


Keywords

GEMET
eau gestion du risque micro-organisme milieu aquatique physicochimie pollution pollution de la ville ruisseau sédiment étude de milieu
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Installations de suivi environnemental
theme.OZCAR-Theia.rdf
Bacteria and virus abundance Bacteria and virus diversity

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