Microbiologie du bassin-versant Ratier de l'Yzeron: analyse qPCR des biofilms se développant sur germcatchers (billes d'argile), campagne 2022
- DESCRIPTION DE LA DONNÉE:
Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron via l'utilisation de pièges passifs (billes d'argile / germcatchers) favorables au développement de biofilms. Les germcatchers ont été positionnés à l'exutoire du Ratier
- FORMAT
Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement des germcatchers (billes d'argile) étudiés
- CONTEXTE (DANS LE CADRE DE QUEL PROJET? QUI EST LE PROPRIÉTAIRE?...)
Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales dont les ruissellements urbains
- BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?)
Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon.
- LIEU
exutoire du bassin-versant du Ratier
- PÉRIODE
positionnement en rivière de germcatchers entre Avril - juin 2022
Simple
- Date (Creation)
- 2022-12
- Purpose
- Validation du dispositif billes - d'argile / germcatchers en rivière
- Status
- Under development
- Maintenance and update frequency
- As needed
- GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
-
- Habitats et biotopes
- Répartition des espèces
- GEMET
-
- gestion des eaux superficielles
- assainissement urbain
- pollution
- eau pluviale
- eau
- theme.OZCAR-Theia.rdf
-
- Bacteria and virus diversity
- Surface runoff
- Bacteria and virus abundance
- Variables
- Escherichia coli
- Keywords
-
- SNO Observil
- ZABR
- Sites OTHU
-
- Bassin versant de l'Yzeron
- Access constraints
- Copyright
- Use constraints
- Copyright
- Other constraints
- Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Topic category
-
- Environment
- Inland waters
- Begin date
- 2022-04-01
- End date
- 2022-07-01
- Description
- Bassin versant de l'Yzeron
- Description
- Bassin versant de l'Yzeron
- Distribution format
-
-
txt/csv
(
MST qPCR Germcatchers Exutoire Ratier v1
)
-
txt/csv
(
MST qPCR Germcatchers Exutoire Ratier v1
)
- OnLine resource
- Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
- OnLine resource
-
OTHU site web
(
WWW:LINK-1.0-http--related
)
OTHU site web
- Hierarchy level
- Dataset
Conformance result
- Date (Creation)
- 2022-11-23
- Explanation
- Non évalué
- Pass
- Yes
- Statement
- producteur: UMR LEM - BPOE; qPCR MST sur ADN de germcatchers; ADN extraits de germcatchers/billes d'argile incubées sur différente période en rivière à l'exutoire du Ratier; données brutes de quantités de copies d'un ADN cible selon unités indiquées dans le tableau xls et normalisation (ratio) sur des cibles de référence (16S rRNA gene ou cible Bacteroidales général)
- File identifier
- 9a39c1aa-c269-4b5b-9ff2-f9239a9a04ce XML
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Parent identifier
- Site du bassin versant de l'Yzeron 263968b1-9b85-4342-bd64-a020b041e8ab
- Hierarchy level
- Dataset
- Date stamp
- 2023-03-27T07:23:28
- Metadata standard name
- ISO 19115:2003/19139
- Metadata standard version
- 1.0