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Qualité microbiologique : évaluations de la qualité microbiologique et physicochimiques de sédiments urbains de Django-R et Garibaldi par qPCR, spectroscopie à dispersion et microscopie électronique à balayage (2023/2024)

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données physicochimiques sur des sédiments urbains (pH, poids sec, ions, éléments traces métallique, N, P, Hydrocarbure aromatique polycyclique) échantillonnés sur 9 zones de la métropole de Lyon (avec 3 typologies) pendant 3 saisons. Ces données sont associées à d'autres concernant la qualité microbiologique de ces sédiments via qPCR des ADN avec les marqueurs de la trousse OTHU. Ces données sont complétées par des images produites par microscopie électronique à balayage des microorganismes présents.

- FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (paramètres généraux, pH, Chimie, ADN, quantification qPCR)

- CONTEXTE : L'étude des sédiments urbains en terme microbiologique et physicochimiques permets de faire le lien entre chimie et présence de microorganismes, et en particulier de pathogènes. Ces données sont associés à des images de microscopie électronique à balayage pour visualiser la diversité des formes microbiennes et les rendre accessibles au publique.

Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des sédiments urbains remobilisés par temps de pluie au niveau de la métropole. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans

- LIEU : métropole de Lyon

- PÉRIODE : novembre 2023 à juin 2024

Simple

Date (Creation)
2024-01
Purpose
Etude de la qualité microbiologique des sédiments urbains de la métropole de Lyon
Status
Under development
Owner
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Benoit COURNOYER
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Custodian
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Baptiste Luton
Author
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Baptiste Luton
Maintenance and update frequency
Continual
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Installations de suivi environnemental
GEMET
  • polluant chimique
  • micro-organisme
  • sédiment
  • pollution
  • gestion du risque
  • microscopie
  • ville
theme.OZCAR-Theia.rdf
  • Bacteria and virus abundance
  • Bacteria and virus diversity
Keywords
  • SNO Observil
  • ZABR
Sites OTHU
  • Chassieu Rétention/Infiltration
Use limitation
Accord de réutilisation de données en accès privé et exclusif
Access constraints
Copyright
Use constraints
Other restrictions
Other constraints
Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Topic category
  • Environment
  • Health
  • Biota
Begin date
2023-11-05
End date
2024-06-18
Description
Bassin versant de l'Yzeron
Description
Chassieu Rétention/Infiltration
N
S
E
W
thumbnail


Distribution format
  • txt/csv ( )

OnLine resource
Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
OnLine resource
OTHU site web ( WWW:LINK-1.0-http--related )

OTHU site web

Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date (Publication)
2010-11-23
Explanation
Non évalué
Pass
No
Statement

producteur: UMR LEM - BPOE; qPCR sur ADN issus de sédiments. Données brutes de quantités de copies d'un ADN cible selon unités indiquées dans le tableau xls et normalisation (ratio) si besoin sur des cibles de référence (16S rRNA gene)

Données de comptage de cellules sur images de microcopie électronique à balayage.

Données de quantification des nutriments, des éléments traces métalliques et Hydrocarbure aromatique polycyclique en g ou µg/kg de sédiments obtenus par chromatographie ionique. Proportion relatives d'ions mesuré par spectroscopie à dispersion d'énergie

File identifier
e9261e6d-e628-47e6-9181-51bce88b6eb4 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2025-01-27T09:51:44
Metadata standard name
ISO 19115:2003/19139
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  OTHU - Nicolas WALCKER
Villeurbanne , 69100 , France
http://graie.org/othu/index.htm
 
 

Overviews

overview overview overview

Spatial extent

N
S
E
W
thumbnail


Keywords

GEMET
gestion du risque micro-organisme microscopie polluant chimique pollution sédiment ville
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Installations de suivi environnemental
theme.OZCAR-Theia.rdf
Bacteria and virus abundance Bacteria and virus diversity

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